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蚊蟲攜帶的多樣化微生物組（microbiome）可影響其傳播病原體的潛力。然而，目前對蚊蟲微生物組的結構組成及其生態驅動因素仍知之甚少，在蚊媒傳染病高發的非洲地區，相關研究尤為缺乏。
2026年1月20日，中國科學院武漢病毒研究所袁志明/夏菡團隊、鄭振華團隊合作在國際學術期刊mSystems發表題為“Host and geography shape microbial communities in Kenyan mosquitoes: insights from metatranscriptomics”（宏轉錄組學揭示宿主與地理特征共同塑造肯尼亞蚊蟲微生物組）的研究論文。
研究對2019-2023年間從肯尼亞8個生態區采集的伊蚊和庫蚊（圖1A），采用宏轉錄組學技術并結合多維度統計建模與共現網絡（co-occurrence network）分析，發現肯尼亞蚊蟲微生物組呈現的特征為病毒在數量上占優勢，而細菌則主導種類多樣性（圖1B）。在宏觀尺度上，地理區域是決定其微生物組整體構成的首要因素；而在局部尺度（如城市/采樣點），蚊蟲的種類則成為影響其微生物組多樣性的關鍵。進一步分析表明，伊蚊與庫蚊的微生物共現網絡存在差異顯著。伊蚊的微生物網絡相對庫蚊更為穩固，伊蚊網絡中以細菌類群為核心樞紐，庫蚊網絡中病毒扮演更為關鍵的角色（圖1D）。此外，研究團隊從這些蚊蟲中鑒定出102種病毒序列，分屬24個不同的病毒科，其中31種為潛在的新型RNA病毒。系統發育分析還揭示，在布尼亞病毒目、小RNA病毒目等已知大類中，存在尚未被分類的進化分支（圖1C）。
該研究系統闡明了肯尼亞蚊蟲微生物組的結構組成特征與驅動因素，為基于生態地理學的病媒生物監測和未來開發針對微生物組的病媒生物干預策略提供了新思路。
武漢病毒所助理研究員張乃樓、研究生Evans Atoni為該論文共同第一作者，武漢病毒研究所夏菡研究員、袁志明研究員、廣州海關技術中心戴俊主任醫師為論文共同通訊作者，武漢病毒所鄭振華研究員、肯尼亞自然博物館（National Museum of Kenya）Bernard Agwanda研究員等為該項研究的合作作者。該研究得到國家重點研發計劃項目、中國科學院中非中心的資助。
圖1. 肯尼亞蚊蟲微生物組
（A）蚊蟲采樣地點及微生物組組成；（B）細菌和病毒組成的α和β多樣性分析；
（C）病毒類群的系統發育分析；（D）伊蚊和庫蚊微生物群落的共線性網絡。
文章鏈接：https://journals.asm.org/doi/10.1128/msystems.01427-25